目錄第1章 組蛋白、核小體和染色質(zhì)結(jié)構(gòu) 1 1.1 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)簡介 1 1.2 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)研究歷史 3 1.3 核小體核心顆粒結(jié)構(gòu) 4 1.4 連接組蛋白和染色質(zhì)小體 16 1.5 染色質(zhì)的高級結(jié)構(gòu) 16 1.6 展望 19 致謝 19 參考文獻 19 第2章 在染色質(zhì)組裝和解聚中的組蛋白分子伴侶 25 2.1 簡介 25 2.2 組蛋白從細胞質(zhì)到細胞核的轉(zhuǎn)運 29 2.3 復(fù)制依賴性染色質(zhì)組裝 31 2.4 著絲粒染色質(zhì)的重新組裝 36 2.5 組蛋白分子伴侶與復(fù)制非依賴性染色質(zhì)解聚和組裝 39 2.6 DNA修復(fù)過程中染色質(zhì)組裝和解聚中的組蛋白分子伴侶 44 2.7 結(jié)束語 46 參考文獻 46 第3章 染色質(zhì)重塑復(fù)合物 57 3.1 簡介 57 3.2 重塑因子分類 60 3.3 重塑機制和調(diào)控 73 3.4 重塑因子在特定染色體加工中的功能 82 3.5 參與細胞多能性、發(fā)育和分化調(diào)節(jié)的重塑因子 93 3.6 重塑因子與癌癥 99 3.7 染色質(zhì)重塑因子和疾病綜合征 102 參考文獻 104 第4章 組蛋白乙酰化對染色質(zhì)的調(diào)節(jié) 124 4.1 簡介 125 4.2 組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶及其復(fù)合物 127 4.3 組蛋白去乙酰化 133 iv 染色質(zhì)基礎(chǔ)與表觀遺傳學(xué)調(diào)控 4.4 乙酰化模塊閱讀器 137 4.5 組蛋白乙酰化對染色質(zhì)/核小體結(jié)構(gòu)的影響 138 4.6 組蛋白乙酰化在組蛋白沉積和染色質(zhì)組裝中的作用 139 4.7 組蛋白乙酰化在基因表達調(diào)控中的功能 142 4.8 DNA 修復(fù)中組蛋白乙酰化的作用 146 4.9 酶相互作用調(diào)節(jié)組蛋白乙酰化及與其他修飾的串?dāng)_ 149 4.10 組蛋白乙酰化與人類疾病和藥物靶標(biāo)的出現(xiàn) 151 4.11 展望：組蛋白乙酰化與細胞代謝之間的聯(lián)系 154 致謝 155 參考文獻 155 第5章 染色質(zhì)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中的組蛋白甲基化 182 5.1 簡介 182 5.2 組蛋白甲基化：歷史的視角 185 5.3 組蛋白賴氨酸甲基化信號傳遞 186 5.4 組蛋白甲基化和DNA甲基化 203 5.5 組蛋白甲基化和腫瘤 205 5.6 組蛋白精氨酸甲基化 207 致謝 208 參考文獻 209 第6章 組蛋白泛素化調(diào)控基因表達 220 6.1 泛素化是一種可逆的翻譯后修飾 221 6.2 組蛋白的泛素化修飾 222 6.3 特異性E2/E3酶催化組蛋白單泛素化 224 6.4 組蛋白的單泛素化可以被去泛素化酶逆轉(zhuǎn) 231 6.5 組蛋白單泛素化調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄 233 6.6 組蛋白泛素化和DNA修復(fù) 248 6.7 組蛋白單泛素化調(diào)控細胞周期 253 6.8 結(jié)論 253 參考文獻 254 第7章 PARP-1和ADP-核糖基化對染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的調(diào)控 262 7.1 簡介 262 7.2 PARP-1、聚ADP-核糖基化和PARP家族 262 7.3 PARP-1對染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和基因表達的調(diào)控 266 7.4 PARP-1在異染色質(zhì)中的功能 274 7.5 PARP-1定位和染色質(zhì)活性的調(diào)節(jié) 276 7.6 總結(jié)和結(jié)論 281 參考文獻 281 第8章 組蛋白磷酸化和染色質(zhì)動力學(xué) 287 8.1 簡介 287 8.2 組蛋白H1磷酸化 288 8.3 組蛋白H3磷酸化 290 8.4 組蛋白H2A磷酸化 291 8.5 閱讀器蛋白翻譯組蛋白修飾 294 8.6 結(jié)論和展望 294 參考文獻 295 第9章 組蛋白修飾的讀取 299 9.1 簡介 299 9.2 組蛋白修飾模塊的讀取 302 9.3 讀取方法 303 9.4 讀取的特異性 306 9.5 讀取組蛋白修飾的功能效果 307 9.6 展望 310 致謝 311 參考文獻 311 第10章 組蛋白變體的性質(zhì)和功能 316 10.1 簡介 316 10.2 組蛋白變體的特征 321 10.3 組蛋白變體在DNA上的沉積 324 10.4 組蛋白變體的重要性 331 參考文獻 344 第11章 染色質(zhì)的轉(zhuǎn)錄 361 11.1 簡介 361 11.2 轉(zhuǎn)錄周期 362 11.3 基因上的染色質(zhì)結(jié)構(gòu) 370 11.4 轉(zhuǎn)錄相關(guān)的轉(zhuǎn)錄后修飾 371 11.5 轉(zhuǎn)錄中的染色質(zhì)重塑 380 11.6 延伸過程的組蛋白動力學(xué) 384 11.7 調(diào)控延伸過程的組蛋白動力學(xué) 385 11.8 非編碼轉(zhuǎn)錄：調(diào)節(jié)和結(jié)果 389 11.9 結(jié)論 391 參考文獻 392 第12章 DNA修復(fù)和復(fù)制過程中的染色質(zhì)重塑 416 12.1 簡介 416 12.2 DNA 雙鏈損傷修復(fù)中的染色質(zhì)重塑 416 12.3 DNA復(fù)制過程中的染色質(zhì)重塑 434 12.4 結(jié)束語 438 參考文獻 438 第13章 異染色質(zhì)：基因組的重要成分 447 13.1 為什么研究異染色質(zhì)? 448 13.2 異染色質(zhì)的構(gòu)成 449 13.3 異染色質(zhì)組裝 453 13.4 異染色質(zhì)的遺傳剖析 454 13.5 異染色質(zhì)形成：RNAi的作用 456 13.6 核組織動力學(xué) 458 13.7 異染色質(zhì)與疾病 460 13.8 異染色質(zhì)的未解之謎 461 參考文獻 461 第14章 染色質(zhì)研究新興領(lǐng)域 468 14.1 細胞信號的重要性 468 14.2 染色質(zhì)接受應(yīng)激活化蛋白激酶的信號 468 14.3 應(yīng)激信號、S期進展和轉(zhuǎn)錄相關(guān)重組 470 14.4 非編碼RNA參與表觀遺傳調(diào)控 470 14.5 細胞代謝對組蛋白修飾的影響 473 14.6 生物鐘中組蛋白修飾的波動 476 14.7 DNA甲基化決定細胞類型的特異性 477 14.8 表觀遺傳學(xué)和衰老 478 14.9 結(jié)論和展望 479 致謝 479 參考文獻 479